王望高与西班牙人联合作战大败林阿凤，得到西班牙人热情款待，建立起良好友情，却没能帮到西班牙使者见到福建巡抚刘尧诲和总兵胡守仁。

王望高深表歉意，启程前宴请圣奥古斯丁神父一行，西班牙人离厦门中左所赶赴菲律宾，西班牙人此番大明沿海之行也并非没有收获，至少查探清楚大明沿海军民状况及沿海洋流、海路水道、海岛港口。

林阿凤攻取吕宋在明朝与西班牙人联合围剿下下失败，林阿凤败逃到东番魍港休整，加紧赶造战船。西班牙使者沿途刺探消息，得知林阿凤已逃到附近的东番岛上，有人主张去袭击林阿凤，但还是放弃了，随即返回马尼拉。

林阿凤在魍港休整恢复后率部众进攻大明闽粤沿海，以东番魍港为基地四处劫掠，船舰又增至150余艘，势力复振，对大明东南沿海形成严重威胁。

福建总兵胡守仁率福建水师再次击败林阿凤，林阿凤引兵退至广东进犯潮州。当时潮州的参政金浙主抚，林凤见闽粤两省水师兵力再也不羸弱，已经变得强大起来，心灰意冷的林阿凤不作进一步的抵抗准备。

林阿凤手下马志善、李成等一千七百一十二人被招降，六百六十八名男女百姓被收容。林阿凤素知明朝对待所有盗贼一向都是毫不留情，只身逃离潮州，不知所终。

菲律宾马尼拉殖民当局鼓励招募大明商人贩运货物至马尼拉贸易，开始无人敢去，胆大敢于冒险的安平商人李寓西李光缙兄率先前往吕宋马尼拉与西班牙人贸易成功，随即带领大批安平商人前往马尼拉与西班牙商人商贸往来。

西班牙人成功在菲律宾马尼拉建立与大明商贸往来，并结合大明造船技术打造马尼拉大帆船。明朝与菲律宾西班牙殖民当局联手击败林阿凤，双方关系比较融洽，大帆船贸易随之兴起。

马尼拉大帆船载重一般在400吨，每年6月乘西南季风自马尼拉启航北上，至北纬4542水域，顺北太平洋上的黑潮东行，抵达阿卡普尔科港，行程万余海里，历时约6个月。回程系顺洋流直航，仅需3个月。

去程把大明、印度、波斯、日本等国的丝绸、瓷器、漆器、棉布、象牙、地毯、茶叶等商品以及菲律宾的织绣、珍珠、木雕等从马尼拉运送到墨西哥的阿卡普尔科港，销售于墨西哥及西属美洲各地，并转销西班牙本土。回程主要载运西班牙银元、铜、可可等。

明朝在与西班牙的商贸往来中处于贸易出超地位，西班牙在美洲的殖民地成为了生产基地。明朝的丝绸、生丝基本垄断了墨西哥市场。大帆船贸易给明朝带来了大量的美洲白银，严重冲击明朝经济市场，导致明朝物价飞涨。

菲律宾西班牙马尼拉当局一面在与大明商人做生意，同时也在开始积极考察分析大明国情民情，对大明东南福建沿海进行侦查，熟悉福建东南沿海航线，为征服明朝做准备。

大帆船贸易兴起后，大明与西班牙人之间的贸易逆差越来越大，双方矛盾也越来越大，吕宋的闽粤汉人移民掌握着当地经济命脉，与菲律宾土着之间矛盾重重，菲律宾西班牙殖民当局明显有偏袒当地土着，利用土着势力制衡汉人移民。