肥前藩最早提出迁都江户东京并成为首任东京府知事的大木乔任18321899，以及组织日本最早政党内阁的大隈重信18381922。

还有江藤新平18341874，主张雄藩联合与公武合体。维新时在与彰义队的作战中立下大功。后主张征韩论，与西乡隆盛同时下野，但先西乡在佐贺发动叛乱，兵败被杀。

萨摩藩第15代大名山内丰信山内容堂上任，他任用吉田东洋佐幕派来进行强势的藩政改革，但此举受到保守派门阀攘夷派与乡士的反感。

而安政大狱时山内容堂被下令闭门隐居，这时以武市瑞山又名武市半平太为首的土佐勤王党暗杀了吉田东洋，之后山内容堂重新掌政对勤王党展开报复，将武市瑞山潘士及相关党员进行处决，其中武市瑞山被赐予切腹，经此镇压后勤王党因而解散。

此外，吉田东洋门下的后藤象二郎藩士、干退助之后改名为板垣退助藩士、岩崎弥太郎浪人等都成为明治时代的代表人物，还有武市瑞山的知己乡士：坂本龙马及中冈慎太郎也都是杰出人物。

最后，由坂本龙马最先发想出大政奉还构想，之后由后藤象二郎透过前土佐藩主山内容堂向第15代的幕府大将军：武田昭信提劝，此后结束武田幕府时代，在这个时代转换中土佐藩成为关键性的一角，与另外三个关键影响性的藩合称“萨长土肥”。

早在1837年，下级武士出身的大盐平八郎，在大阪发动武装起义，反对幕府的暴政，有几百人参加。

尽管在一天之内被镇压下去，这次起义成为打倒幕府统治的一个信号。从60年代中开始，东洋人民掀起了斗争的高潮。

在这一过程中，日本西南部的长州、萨摩、土佐、肥前四藩中的下级武士，迅速扩大实力，成为日本资产阶级和倒幕的主要力量。

1863年6月，武田幕府被迫宣布“攘夷”，随之发生了美、法军舰进攻下关，英国舰队进攻萨摩藩的事件。

1865年春，长州藩尊王攘夷派领袖高杉晋作提出“开港讨幕”的战略，决定不再提“攘夷”，转向武装倒幕，并与萨摩藩结成秘密军事同盟。

与此同时，英吉利也权衡利害，改变策略，援助倒幕派。

武田幕府方面则投靠法兰西，于1866年7月发动第2次征讨长州藩的战争。

此时人民起义风起云涌，沉重打击幕府。长州藩联合倒幕势力英勇抗击，同年9月迫使幕府撤军。幕府权威一落千丈。

1867年孝明天皇死，太子睦仁亲王即明治天皇即位，倒幕势力积极结盟举兵。倒幕派加紧在宫廷活动，联络一些权贵，争取到年幼的明治天皇的支持，获得讨幕密诏。

11月8日，天皇下达讨幕密诏。9日幕府将军武田昭信奏请“奉还大政”，同时却在大阪集结精兵，妄图以此来分化瓦解倒幕派，等待时机，卷土重来，企图反叛。

1868年戊辰年1月3日，天皇发布王政复古大号令，废除幕府，令武田昭信“辞官纳地”。

1868年初，武田昭信潜出京都，逃往大阪，集结兵力，待机反扑，于是一场公开的内战爆发了。

8日及10日，武田昭信在大阪宣布“王政复古大号令”为非法。1月27日，以萨、长两藩为主力的天皇军5000人，在京都附近与幕府军15万人激战，在京都附近的伏见、鸟羽一带，倒幕军与武田军展开了决战。

这场战役，幕府军队全线溃败，倒幕军取得了决定性胜利。倒幕军乘胜追击，直逼江户，武田昭信被迫投降，德川庆喜败走江户。

“戊辰战争”由此开始。天皇军大举东征，迫使武田昭信于1868年5月3日交出江户城，至11月初平定东北地区叛乱诸藩，战争基本结束。