崇祯十七年四月二十三日，李自成山海关大战溃败的第二日，崇祯皇帝朱由检在太子朱慈烺，锦衣卫指挥使周世显，兵部尚书史可法，以及数千护驾兵马的陪同下，乘坐龙舟抵达了南京城外的燕子矶。

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圣驾在浦口大营登船，近百艘大小船只横渡长江，宛如从天际而来，浩浩荡荡，可谓是“气派非凡”。

南京的官绅数千人，还有无数城中百姓都早已经在城外等候多时，天子圣驾，在这个时代，是神圣无比的，江南又向来富饶，闲人也多，又有官绅安排，自然引得无数人来围观朝见。

崇祯皇帝之前在淮安的时候，已经把这些官员敲打得服服帖帖了，南方堆积如山的政务在他宵衣旰食，夜以继日的几日批阅之下，重要的事情也已经基本处理完毕。

因此，此时整个南京上上下下，除了中央的官员之外，还有不少周围省份的巡抚和将领，也都受诏，前来觐见天子。

朱慈烺好几日之前便连续往返于南京和浦口之间，他受崇祯的命令，负责祭祀的准备工作，又提前检阅了南京京营，准备演习之事，可谓是忙得连轴转。

不过，这也给了他机会，提前和南京的实权太监们熟悉了起来，还有京营里的勋贵们，朱慈烺稍稍抛出了橄榄枝，便有人直接跪了下来，要跟随他建功立业。

毕竟，这样的机会可不多，说不得一辈子就这一次，别人就是想跪，恐怕也没这个地跪。

当然，朱慈烺也并未要与文官作对，那不是他的敌人。只不过是为了避免朝堂失衡，他必须早有准备，李邦华和倪元璐就是他的人，史可法也算半个，这些都是他快速实现自己练兵计划的巨大助力。

崇祯皇帝登岸之后，先是拜谒了孝陵，然后从南京城的朝阳门进城，沿途群情激动，热闹非凡，看得崇祯和周皇后都满心欢喜。便是朱慈烺看了，也不由得佩服起了这个时代的官员，在虚张声势，搞面子工程方面，比后世还要强。

因为南京城的皇宫还没有修复完全，崇祯的圣驾暂时停留在了内守备府。等到第三日的时候，崇祯才得以移驾皇宫，由此也正式颁谕天下，在南京重建朝廷。

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而后，崇祯皇帝依照之前和大臣商议的结果，在南京皇宫正式颁布了南京朝廷的各级官员任命。

原南京兵部尚书史可法为东阁大学士兼兵部尚书，入阁办事原都御史李邦华为东阁大学士，仍任原职原户部尚书倪元璐加东阁大学士，兼任户部尚书马士英加东阁大学士、令右副都御史衔，仍任凤阳总督

与此同时，南京原本的各级官员也做了些许调整，以原詹事府詹事姜曰广为礼部左侍郎，以张慎言为吏部尚书，以高弘图为户部侍郎，以刘宗周为都察院左都御史，其他衙门官员亦先后作了安排。

按照史可法，李邦华，倪元璐等人的意思，这是要让“正人”占据要津，才能使得朝廷有一番新气象。当然，实际上就是要兼顾北京随驾重臣和南京一派的势力分配，以免激起不必要的内部矛盾。

而崇祯皇帝自然不是朱由崧这样的软骨头，他驾驭群臣的手段可不容小觑，手中更有朱慈烺的兵马，既然一开始这样安排，让不少人都得以如愿以偿，平衡了朝廷的力量，之后很长一段时间就不会变了。

与此同时，崇祯在南京重新掌权之后，史可法和马士英两人既没有原本历史上的矛盾，也没有原本历史上的地位。马士英更是没有原本历史上的拥护之功，让他入阁，其实只是崇祯皇帝拉拢这支力量的手段罢了。

文官安排妥当之后，就轮到了原本历史上的“江北四镇”，不过因为朱慈烺的到来，他们都没了原本的威风，同样也没了所谓的拥护之功，加上朱慈烺麾下大军的威慑，如今一个比一个乖。

军事方面的事情崇祯不懂，似乎也真的是吸取了教训，没有再胡乱指挥，全权交给了皇太子朱慈烺来谋划。

相较于原本历史上的安排，朱慈烺根据当前的局势和自己的需要，在驻防地上，稍稍做了一些改变。

手下兵马较强，也忠心耿耿的黄得功驻守庐州府，和州府，刘良佐驻守在凤阳府西南，两人互为犄角，防范来自河南方面的敌人。凤阳总督马士英统制两人，带着他的兵马驻守于两人之后，协助防守。

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